Mengutip Pergub, jalur yang dilalui meliputi Bandara Kulonprogo-Kedundang-Jogja-Brambanan ini ditarget selesai 2020. Stasiun yang akan dilalui di antaranya Stasiun Bandara Kulonprogo, Stasiun Kedundang, Stasiun Wates, Stasiun Kalimenur, Stasiun Sentolo, Stasiun Sedayu, Stasiun Rewulu, Stasiun Patukan, Stasiun Jogja, Stasiun Lempuyangan, Stasiun Timoho, Stasiun Janti, Stasiun Maguwo, Stasiun Kalasan, dan Stasiun Brambanan di selatan Candi Prambanan.
Sementara jalur Borobudur-Samas direncanakan akan selesai pada 2029 mendatang, dengan menghidupkan Jalur kereta dari Borobudur–Jogja– Palbapang hingga pantai Samas.
Adapun untuk Jalur Bandara Kuloprogo–Parangtritis ditargetkan selesai pada 2036. Jalur tersebut meliputi Stasiun Bandara Kulonprogo, Stasiun Pleret, Stasiun Brosot, Stasiun Pantai Baru, Stasiun Samas dan Stasiun Parangtritis. Jalur kereta ini ke depan diharapkan dapat meningkatkan jumlah kunjungan wisatawan dan mengurangi kemacetan di jalan.
Sebelumnya, Menteri Perhubungan (Menhub) Budi Karya Sumadi mengatakan konektivitas Joglosemar menjadi potensi luar biasa. Hal itu menjadi salah satu prioritas yang akan dibangun oleh Kemenhub. Salah satunya, konektivitas jalur kereta api antara Borobudur ke Kulonprogo.